L'Arca 3 de Coneixement del medi natural s'estructura en tres grans blocs temátics molt semblants (éssers vius, entorn i planeta Terra; animals, moviment i nutrició; plantes, algues i fongs) que organitzen les dotze unitats de programació del llibre. Té com a dues característiques principals diferenciadores un enfocament interdisciplinari que defuig la fragmentació inconnexa dels continguts, i una aposta per un eix transversal que está adquirint una relleváncia inigualable: L'educació per a la salut (o, més ben dit, per a la promoció de la salut), un dels eixos transversals més treballats a les escoles catalanes, sobretot durant l'últim decenni, i que engloba gairebé la resta d'eixos.
